1.技術(shù)要求高，普遍推廣較困難
因作物不同品種和不同生長(zhǎng)階段對(duì)養(yǎng)分的需求不同，導(dǎo)致營(yíng)養(yǎng)液的配置與管理需要有接受過(guò)技術(shù)培訓(xùn)的專業(yè)人員完成，不能廣泛地被一般的勞動(dòng)者所掌握．營(yíng)養(yǎng)液配置時(shí)所用的專用化肥，市場(chǎng)上不易買到，并且價(jià)格高昂，這也成為了無(wú)土栽培技術(shù)沒有被廣大勞動(dòng)者掌握的原因之一。
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2.廢棄液存在污染環(huán)境的風(fēng)險(xiǎn)
無(wú)土栽培離不了營(yíng)養(yǎng)液，與營(yíng)養(yǎng)液配制相配套需一系列設(shè)備，如，測(cè)試系統(tǒng)、循環(huán)泵等，并且如果是開放式栽培技術(shù)，存在廢棄營(yíng)養(yǎng)液硝酸鹽含量高，排放后易引起水體富營(yíng)養(yǎng)化的危險(xiǎn)；如果是封閉式栽培技術(shù)，營(yíng)養(yǎng)液中大量有機(jī)質(zhì)的存在易滋生病原菌，給作物帶來(lái)毀滅性破壞的風(fēng)險(xiǎn)。
3.系統(tǒng)設(shè)備投資成本高
各種應(yīng)用營(yíng)養(yǎng)液來(lái)灌溉作物的無(wú)土栽培系統(tǒng)，一般每667㎡地一次性投資至少6000元以上，有的甚至高達(dá)５～６萬(wàn)元，即使較實(shí)用的有機(jī)生態(tài)型無(wú)土栽培系統(tǒng)，其一次性投資也達(dá)2000～3000元。為從長(zhǎng)遠(yuǎn)看，通過(guò)引進(jìn)國(guó)外設(shè)備和技術(shù)進(jìn)行本土化改良，研究和開發(fā)適合我國(guó)國(guó)情的無(wú)土栽培系統(tǒng)是發(fā)展的關(guān)鍵。
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每個(gè)新興技術(shù)在應(yīng)用的過(guò)程或多或少都會(huì)存在這樣或那樣的問(wèn)題，無(wú)土栽培技術(shù)就是一個(gè)非常鮮明的案例，但這項(xiàng)有利于可持續(xù)設(shè)施園藝發(fā)展的技術(shù)還是值得從業(yè)者去探索的，洞悉這項(xiàng)技術(shù)的每一個(gè)細(xì)節(jié)。