目前無土栽培肥料配方有很多種，傳統的配方僅含無機鹽成分，新型的配方會加入活性有機物成分，能夠提高作物長勢、營養價值并降低后期硝酸鹽的含量
所有的無土栽培配方，都需要加入大、中、微量元素，才能真正模擬土壤溶液的成分。而中量元素里的鈣，在高濃度的情況下容易與硫酸根、磷酸根離子形成沉淀，所以如果是真正的無土栽培固體或液體配方，不可能僅通過一種肥料就滿足水培的需求。無土栽培肥料與普通的水溶肥還有兩點非常不同。
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1、酸堿緩沖性強。植物在吸收礦質離子的過程中，會引起土壤溶液的PH值變化；無土栽培由于失去了土壤環境的酸堿緩沖性，需要在營養液的配比上更慎重，并加入緩沖物質，長期使用不會引起酸堿度的劇烈波動。
2、如果用一般的水溶肥，由于配方本身沒有考慮酸堿性的變化問題，種植一段時間后很容易偏酸或偏堿，影響作物長勢。
3、原料要求更高。無土栽培肥料不僅要100%溶解，而且可溶性雜質的量也要盡可能低，否則在沒有土壤緩沖性的情況下，營養液的有害雜質累積很容易讓植物長勢變差。
4、可以這么說，無土栽培肥料能夠完全代替普通的大田用水溶肥；但是普通水溶肥一般不能替代無土栽培肥料。