傳統水產產業通過更換水體維持良好的水質，但因此產生的巨量廢水導致了廣泛的環境問題，如富營養化 。近年來，魚菜共生系統因其生產可持續性、消除營養不良和貧窮的能力而吸引了世界范圍內的關注，并被認為是傳統水產養殖的替代技術。
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1、魚菜共生系統是將水產養殖循環系統和水培蔬菜技術整合為一體化的組合系統。按魚菜共生系統循環的工藝來說，分為 3 種類型。
2、直接共生模式、開環共生模式和閉環共生模式。直接共生模式是采用魚菜直接接觸共生的方法，即養殖池中采用浮筏栽培水生蔬菜，蔬菜直接利用養殖水中的氨氮物質，但吸收率僅為 40%，無法達到其對氨氮等營養的需求，并且其可栽培的面積小，效率不高，還存在雜食性的魚吞食根系的問題，需對根系進行圍篩網保護。
3、開環共生的魚菜共生模式是指養殖池與種植槽之間不形成閉路循環，由養殖池排放的廢水作為一次性灌溉用水直接供應蔬菜種植系統而不返還回流，每次只對養殖池補充新水。
4、閉環共生模式是指養殖池排放的水經硝化床微生物處理后，進入蔬菜栽培系統，再經蔬菜根系的生物吸收過濾，把處理后的廢水返回至養殖池，這種閉鎖環工藝的魚菜共生系統可用于大規模生產，效率高，很大程度上減少水資源的使用。目前常見的閉環魚菜共生類型有：漂浮筏型、營養液膜型和基質床型。這些類型系統中，魚類代謝廢物主要為溶解在水中的氨，通過添加硝化細菌可將氨轉化為亞硝酸鹽，進而轉化為蔬菜作物生長所需的硝酸鹽 。
5、養殖廢水被循環到植物水培部分進行消化，同時蔬菜從其中吸收營養，然后凈化的水將重新用于魚類養殖。在這個過程中，使用集約化循環技術的魚菜共生系統僅需補充少量的魚池水體，沒有廢水的排放，既滿足了高品質新鮮魚類和蔬菜生產的需求，又避免了污染環境的養分流失。