生態型無土栽培系統必須在保護地中應用，必須有充足的水源。在荒灘也可建造種植，但溫室結構必須合理。如果用舊溫室改造，則必須將溫室徹底清理干凈，同時用臭氧或紫外線充分消毒。
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1、建栽培槽：可用紅磚、塑料板、水泥板等建造。也可直接在棚內下挖，然后鋪聚氯乙烯膜與土壤隔離。栽培槽的標準為高20—25厘米，寬45—50厘米，槽距70—80厘米，南北走向。
2、基質與肥料配比：用草炭、爐渣的混合基質，二者的比例為4:6，適合多種作物栽培；肥料的配比可采用兩種形式，全有機型，能達互高檔有機食品的要求。有機無機結合型，能達到綠色食品A級要求以及無公害食品要求。
3、全有機型：消毒膨化雞糞:豆餅＝2:1。有機無機型：專用肥:消毒膨化雞糞=3:7；將基質按比例調好，全有機型的每立方米基質中混入10千克消毒雞糞，5千克豆餅。有機無機型的，每立方米基質中加7千克消毒雞糞，3千克專用肥。
4、裝槽：在槽中鋪上5厘米厚的石子，石子上鋪上紡織帶，將混勻的基質裝入備好的槽中，整平，最后用自來水對每個栽培槽的基質大水漫 。待水分滲下后，再覆蓋薄膜10—15天，以利肥料充分分解。
5、安裝滴灌設備：把準備好的滴灌帶裝于基質槽的中間，每槽內鋪設滴灌帶2條，也可用其他金屬和塑料供水管道。
6、育苗：育苗采用工廠化育苗，將培育的適齡壯苗定植到栽培槽中。
7、定植：茄果類蔬菜的株距為30—50厘米，每槽栽兩行，苗子最好相互交錯栽培，定植后要立即澆水。
8、管理：與一般栽培相同，根據不同作物進行溫、濕度調控。灌溉與施肥要視情況定期滴灌。追肥一般在定植后20天左右開始，此后每10天追施1次，將肥料均勻撒在離根5厘米以外的周圍，每次每立方米基質加入2.5千克有機肥。
9、防治病蟲害：為生產出綠色食品，有機栽培一般采用臭氧滅害儀或紫外線消毒器進行滅菌，用防蟲網封閉放風口，以防止害蟲傳播。